кстати разберуся хоть за день с линуксом?
смотря с чем и в каком дистрибутиве разбираться, но инфы и инете уже валом.
и в чем всетаки преимущества его?
В том что он Linux

или просто работа безотказней?
Гораздо стабильнее винды, кто и что бы не говорил. Проверенно годами на серверах и более года на домашнем компе.
Самое главное свободное ПО и никаких проблем с покупкой лицензий и т.д.
Для серверов однозначно linux.
софт под него заточенный отсутствует для винды?
что-то не совсем понял вопрос. если имелся ввиду софт из под линуха, то некоторые вещи есть и в винде, но работают они не так уже как в линухе. А вообще практически все с исходниками так что можешь и под винду попробовать скомпилить что захочется

2 модема в сети будет, один вай фай( вообще как точка доступа планируется). соединения где лучше поднимать- на компе, на каждом модеме по одному или еще как...
комп с линухом в качестве шлюза, в него на прямую два модема, а в другую сетевую остальную локалку. Вариантов как делить инет на линухе тоже уже не мало и работать думаю будет быстрее.
где лучше поднимать соединения зависит от того как построены сеть будет.